パーティション操作専用のLinuxディストリビューションがある。

http://gparted.sourceforge.net/

Windowsのディスク管理ツールではUSBメモリーのパーティション操作ができないが、こちらのCDで起動させてディスクに対して様々な操作が可能になる。

もちろんオープンソースで使用には費用がかからない。

• Create a partition table on a disk device.
• Enable and disable partition flags such as boot and hidden.
• Perform actions with partitions such as:
  • create or delete
  • resize or move
  • check
  • label
  • copy and paste

私の場合はUSB起動のLinuxを作成しようとして失敗したUSBメモリーを、もう一度Windowsで使う時に元のパーティションを削除するために使用した。

詳しい使い方等は以下のサイトを参考にしてください。

日経Linuxの記事 ”パーティション操作専用のLinux　GParted LiveCD”
http://itpro.nikkeibp.co.jp/article/COLUMN/20070416/268352/